No estado do Amazonas, atualmente a OPAN desenvolve trabalhos no sul do estado em parceria com os povos indígenas Paumari do rio Tapauá, Apurinã e Jamamadi, na região do Médio rio Purus; Kawahiva na bacia do rio Madeira, e, na região sudoeste, com os Deni do rio Xeruã: na bacia do Médio rio Juruá.
Entre as ações, estão o apoio às cadeias de valor da sociobiodiversidade, a ações de vigilância e proteção territorial e de fortalecimento das associações indígenas.
Com o objetivo de fortalecer a defesa dos direitos indígenas, a OPAN inaugurou em 2013 o Programa de Direitos Indígenas, Política Indigenista e Informação à Sociedade, que apoia a participação e promove a articulação política e mobilização dos povos frente às ameaças que incidem sobre seus direitos constitucionais.
O programa se propõe a desenvolver ações integradas em níveis local, regional, nacional e internacional. Atua no contexto das aldeias, abordando temas caros à sua sustentabilidade física, cultural e territorial.
A OPAN atua em Mato Grosso, no norte e noroeste do estado, junto aos indígenas Apiaká, Nambikwara e outros povos da Terra Indígena Pirineus de Souza, Manoki, Myky, Paresi e Rikbaktsa, e na região da sub-bacia do rio Juruena.
A leste do estado, interflúvio dos rios Xingu e Araguaia, atua com o povo Xavante de Marãiwatsédé.